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苹果的短信不会自动删除。如果短信自动删除，可能有以下几种原因。
1、短信存储空间满了，导致部分短信被自动删除，iPhone手机默认只能存储一定数量的短信，超出容量后系统会自动清理之前的短信，这种情况下可以尝试删除一些不需要的短信或者清理短信缓存。
2、手机系统问题导致短信被自动删除，可以尝试更新手机系统或者恢复默认设置来解决这个问题。
3、如果在iCloud设置中开启了短信备份功能，并且备份时间较早，那么当手机内存不足时，系统会自动清理较早的备份文件，也可能导致短信被删除，可以尝试关闭自动备份功能或者备份最新的短信数据。
苹果的短信不会自动删除，如果出现这种情况，可以尝试以上方法解决问题，如果问题仍然存在，建议联系苹果官方客服寻求帮助。